عملية تحويل المسار ثنائي التقسيم ( الساسي) ككل عملية جراحية يتعرض لها الإنسان يوجد الكثير من المخاطر والمضاعفات الصحية،
وحسب أخلاقيات مهنة الطب فإنه يجب على الطبيب المختص إخبار المريض بكافة هذه المخاطر والمضاعفات قبل اتخاذه القرار بإجراء للعملية، ومن أهم المضاعفات التي يجب التنويه لها:
من المضاعفات الشهيرة لعملية الساسي هو خطر تسرب محتويات المعدة، فيمكن أن يحدث أحيانًا تسريب لمحتويات المعدة منها إلى الخارج حيث توجد الأعضاء الداخلية المجاورة،
عند التعرض لهذه الحالة يتطلب الأمر تدخلًا طبيًا عاجلًا أيضًا لإيقاف التسريب وتدارك الوضع. وفي ويمكن تجنب ذلك في البداية باستخدام أحدث الأدوات الطبية والدباسات في إجراء عملية ثنائي التقسيم بالمنظار.
من المضاعفات التي يمكن أن تحدث بعد عملية الساسي هي احتمالية زيادة وزن المريض مرة أخرى
وذلك لأن الخلايا الدهنية الخاصة به ما زالت موجودة، وبالتالي ما زالت احتمالية زيادة الوزن موجودة خاصة مع عدم اتباع الإرشادات الصحية.
كما توجد أيضًا بعض المخاطر المتعلقة بعملية تخدير المريض قبل العملية والتي يمكن تجنبها بوجود طبيب تخدير متخصص ذو خبرة جيدة.
مخاطر حدوث نزيف دموي أيضاً من المخاطر المحتملة، إلا أن المهارة العالية للطبيب الجراح والإمكانيات الطبية المتطورة المتوفرة، يساهمان بشكل كبير في تقليل احتمالية حدوث هذا النزيف أثناء إجراء
ثنائي التقسيم بالمنظار،
يجب التنويه إلى أن النزيف يعد مضاعفًا لأي عملية جراحية يقوم بها الإنسان مهما كانت بسيطة،
وفي هذه الحالة ينبغي الإسراع في التدخل الطبي؛ حتى لا يؤثر هذا النزيف على وظائف الجسم الأخرى بشكل أو بآخر.